Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shc1P98083 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Shc1P98083 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Shc1P98083 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shc1P98083 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shc1P98083 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shc1P98083 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shc1P98083 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shc1P98083 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shc1P98083 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shc1P98083 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shc1P98083 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Shc1P98083 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms