Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx1P81068 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Irx1P81068 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx1P81068 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx1P81068 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx1P81068 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx1P81068 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx1P81068 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms