Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx3P81067 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx3P81067 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx3P81067 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irx3P81067 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irx3P81067 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Irx3P81067 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irx3P81067 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irx3P81067 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Irx3P81067 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Irx3P81067 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx3P81067 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx3P81067 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx3P81067 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms