Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps11P62281 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms