Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

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Length 193 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SftpcP21841 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SftpcP21841 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SftpcP21841 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SftpcP21841 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SftpcP21841 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SftpcP21841 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SftpcP21841 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SftpcP21841 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SftpcP21841 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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SftpcP21841 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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SftpcP21841 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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SftpcP21841 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SftpcP21841 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
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SftpcP21841 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SftpcP21841 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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