Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms