Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Fcer1aP20489 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Fcer1aP20489 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Fcer1aP20489 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Fcer1aP20489 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fcer1aP20489 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms