Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtaP09225 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtaP09225 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtaP09225 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtaP09225 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
LtaP09225 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
LtaP09225 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtaP09225 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtaP09225 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
LtaP09225 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtaP09225 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtaP09225 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtaP09225 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtaP09225 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtaP09225 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtaP09225 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtaP09225 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
LtaP09225 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtaP09225 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtaP09225 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
LtaP09225 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtaP09225 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtaP09225 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtaP09225 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtaP09225 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtaP09225 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtaP09225 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtaP09225 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtaP09225 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtaP09225 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtaP09225 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtaP09225 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
LtaP09225 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtaP09225 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtaP09225 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LtaP09225 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LtaP09225 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LtaP09225 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LtaP09225 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LtaP09225 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LtaP09225 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LtaP09225 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LtaP09225 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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LtaP09225 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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LtaP09225 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LtaP09225 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LtaP09225 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LtaP09225 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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LtaP09225 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LtaP09225 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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LtaP09225 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LtaP09225 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LtaP09225 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LtaP09225 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LtaP09225 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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LtaP09225 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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LtaP09225 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LtaP09225 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LtaP09225 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LtaP09225 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
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LtaP09225 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LtaP09225 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LtaP09225 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LtaP09225 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LtaP09225 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LtaP09225 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LtaP09225 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LtaP09225 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LtaP09225 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LtaP09225 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LtaP09225 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LtaP09225 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LtaP09225 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LtaP09225 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LtaP09225 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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