Protein–RNA interactions for Protein: P04342

Crygd, Gamma-crystallin D, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrygdP04342 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
CrygdP04342 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
CrygdP04342 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
CrygdP04342 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
CrygdP04342 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
CrygdP04342 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
CrygdP04342 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
CrygdP04342 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
CrygdP04342 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
CrygdP04342 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
CrygdP04342 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
CrygdP04342 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
CrygdP04342 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
CrygdP04342 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
CrygdP04342 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
CrygdP04342 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrygdP04342 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrygdP04342 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrygdP04342 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrygdP04342 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrygdP04342 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrygdP04342 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrygdP04342 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrygdP04342 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrygdP04342 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrygdP04342 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrygdP04342 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrygdP04342 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrygdP04342 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrygdP04342 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrygdP04342 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrygdP04342 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrygdP04342 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrygdP04342 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrygdP04342 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrygdP04342 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrygdP04342 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrygdP04342 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrygdP04342 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrygdP04342 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrygdP04342 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrygdP04342 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrygdP04342 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
CrygdP04342 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
CrygdP04342 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrygdP04342 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrygdP04342 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
CrygdP04342 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
CrygdP04342 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrygdP04342 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
CrygdP04342 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrygdP04342 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrygdP04342 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrygdP04342 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrygdP04342 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrygdP04342 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrygdP04342 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrygdP04342 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrygdP04342 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrygdP04342 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrygdP04342 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrygdP04342 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrygdP04342 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrygdP04342 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrygdP04342 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrygdP04342 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrygdP04342 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrygdP04342 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrygdP04342 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrygdP04342 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrygdP04342 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrygdP04342 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms