Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smarce1O54941 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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