Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Sp100O35892 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Sp100O35892 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sp100O35892 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Sp100O35892 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Sp100O35892 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sp100O35892 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sp100O35892 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Sp100O35892 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Sp100O35892 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Sp100O35892 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Sp100O35892 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
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Sp100O35892 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Sp100O35892 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sp100O35892 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sp100O35892 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sp100O35892 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sp100O35892 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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