Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
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Kcns1O35173 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Kcns1O35173 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Kcns1O35173 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Kcns1O35173 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Kcns1O35173 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
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