Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hps1O08983 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hps1O08983 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hps1O08983 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hps1O08983 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hps1O08983 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hps1O08983 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hps1O08983 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hps1O08983 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hps1O08983 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hps1O08983 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hps1O08983 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hps1O08983 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hps1O08983 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hps1O08983 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hps1O08983 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hps1O08983 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hps1O08983 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hps1O08983 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hps1O08983 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hps1O08983 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hps1O08983 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hps1O08983 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hps1O08983 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hps1O08983 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hps1O08983 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hps1O08983 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hps1O08983 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hps1O08983 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hps1O08983 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hps1O08983 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hps1O08983 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hps1O08983 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hps1O08983 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hps1O08983 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hps1O08983 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hps1O08983 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hps1O08983 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hps1O08983 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hps1O08983 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hps1O08983 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hps1O08983 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hps1O08983 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hps1O08983 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hps1O08983 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hps1O08983 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hps1O08983 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hps1O08983 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hps1O08983 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hps1O08983 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hps1O08983 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hps1O08983 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hps1O08983 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hps1O08983 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hps1O08983 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hps1O08983 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hps1O08983 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hps1O08983 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hps1O08983 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hps1O08983 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hps1O08983 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hps1O08983 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hps1O08983 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hps1O08983 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hps1O08983 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hps1O08983 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hps1O08983 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hps1O08983 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hps1O08983 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hps1O08983 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hps1O08983 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hps1O08983 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hps1O08983 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hps1O08983 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hps1O08983 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hps1O08983 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hps1O08983 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hps1O08983 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hps1O08983 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hps1O08983 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hps1O08983 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hps1O08983 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hps1O08983 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hps1O08983 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hps1O08983 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hps1O08983 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hps1O08983 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hps1O08983 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hps1O08983 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hps1O08983 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hps1O08983 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hps1O08983 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hps1O08983 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hps1O08983 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hps1O08983 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hps1O08983 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hps1O08983 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hps1O08983 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hps1O08983 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hps1O08983 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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