Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Eftud2O08810 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms