Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MttpO08601 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MttpO08601 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
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MttpO08601 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MttpO08601 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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MttpO08601 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
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MttpO08601 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
MttpO08601 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
MttpO08601 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
MttpO08601 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MttpO08601 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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MttpO08601 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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MttpO08601 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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MttpO08601 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MttpO08601 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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MttpO08601 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MttpO08601 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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MttpO08601 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
MttpO08601 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
MttpO08601 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
MttpO08601 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
MttpO08601 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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MttpO08601 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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MttpO08601 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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MttpO08601 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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MttpO08601 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
MttpO08601 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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MttpO08601 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
MttpO08601 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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MttpO08601 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
MttpO08601 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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MttpO08601 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
MttpO08601 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
MttpO08601 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
MttpO08601 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
MttpO08601 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
MttpO08601 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
MttpO08601 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
MttpO08601 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
MttpO08601 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
MttpO08601 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
MttpO08601 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
MttpO08601 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms