Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Elf4-201ENSMUST00000033429 5847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Txnrd1-201ENSMUST00000020484 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Rapgef4os2-201ENSMUST00000128165 2116 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Acss3-203ENSMUST00000165067 4696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Lipg-201ENSMUST00000066532 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Sec22c-201ENSMUST00000078547 5713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 St5-203ENSMUST00000084738 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Grb10-202ENSMUST00000109653 2048 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Gm42031-201ENSMUST00000209823 1885 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Ntrk3-206ENSMUST00000195262 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Gm26865-201ENSMUST00000180970 3284 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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