Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Vmn1r34G3XA52 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Vmn1r34G3XA52 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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