Protein–RNA interactions for Protein: G3X912

Sprtn, SprT-like domain-containing protein Spartan, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SprtnG3X912 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SprtnG3X912 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SprtnG3X912 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SprtnG3X912 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SprtnG3X912 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SprtnG3X912 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SprtnG3X912 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SprtnG3X912 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SprtnG3X912 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SprtnG3X912 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SprtnG3X912 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SprtnG3X912 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms