Protein–RNA interactions for Protein: E9PVF1

Gm6904, Predicted gene 6904, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6904E9PVF1 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6904E9PVF1 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6904E9PVF1 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6904E9PVF1 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6904E9PVF1 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6904E9PVF1 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6904E9PVF1 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6904E9PVF1 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6904E9PVF1 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6904E9PVF1 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6904E9PVF1 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6904E9PVF1 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6904E9PVF1 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6904E9PVF1 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6904E9PVF1 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6904E9PVF1 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6904E9PVF1 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6904E9PVF1 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6904E9PVF1 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6904E9PVF1 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6904E9PVF1 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6904E9PVF1 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6904E9PVF1 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6904E9PVF1 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6904E9PVF1 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6904E9PVF1 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6904E9PVF1 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6904E9PVF1 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6904E9PVF1 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6904E9PVF1 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6904E9PVF1 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6904E9PVF1 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6904E9PVF1 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6904E9PVF1 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6904E9PVF1 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6904E9PVF1 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm6904E9PVF1 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm6904E9PVF1 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm6904E9PVF1 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm6904E9PVF1 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm6904E9PVF1 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6904E9PVF1 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6904E9PVF1 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6904E9PVF1 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6904E9PVF1 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6904E9PVF1 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6904E9PVF1 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6904E9PVF1 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6904E9PVF1 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6904E9PVF1 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6904E9PVF1 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6904E9PVF1 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6904E9PVF1 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6904E9PVF1 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6904E9PVF1 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6904E9PVF1 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6904E9PVF1 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6904E9PVF1 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6904E9PVF1 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6904E9PVF1 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6904E9PVF1 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6904E9PVF1 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6904E9PVF1 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6904E9PVF1 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6904E9PVF1 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6904E9PVF1 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6904E9PVF1 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6904E9PVF1 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6904E9PVF1 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6904E9PVF1 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6904E9PVF1 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6904E9PVF1 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6904E9PVF1 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6904E9PVF1 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6904E9PVF1 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6904E9PVF1 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6904E9PVF1 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6904E9PVF1 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6904E9PVF1 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6904E9PVF1 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6904E9PVF1 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6904E9PVF1 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6904E9PVF1 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6904E9PVF1 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6904E9PVF1 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6904E9PVF1 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6904E9PVF1 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6904E9PVF1 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6904E9PVF1 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6904E9PVF1 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6904E9PVF1 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6904E9PVF1 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6904E9PVF1 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6904E9PVF1 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6904E9PVF1 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6904E9PVF1 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6904E9PVF1 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6904E9PVF1 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6904E9PVF1 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6904E9PVF1 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms