Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms