Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms