Protein–RNA interactions for Protein: A2ABU4

Myom3, Myomesin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myom3A2ABU4 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms