Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm3550W4VSN7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm3550W4VSN7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm3550W4VSN7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm3550W4VSN7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm3550W4VSN7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm3550W4VSN7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm3550W4VSN7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm3550W4VSN7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm3550W4VSN7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm3550W4VSN7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm3550W4VSN7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm3550W4VSN7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm3550W4VSN7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm3550W4VSN7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm3550W4VSN7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm3550W4VSN7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm3550W4VSN7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm3550W4VSN7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm3550W4VSN7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm3550W4VSN7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm3550W4VSN7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm3550W4VSN7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm3550W4VSN7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm3550W4VSN7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm3550W4VSN7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3550W4VSN7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms