Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Homer1Q9Z2Y3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Homer1Q9Z2Y3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Homer1Q9Z2Y3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Homer1Q9Z2Y3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Homer1Q9Z2Y3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Homer1Q9Z2Y3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Homer1Q9Z2Y3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Homer1Q9Z2Y3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Homer1Q9Z2Y3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Homer1Q9Z2Y3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Homer1Q9Z2Y3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Homer1Q9Z2Y3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Homer1Q9Z2Y3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Homer1Q9Z2Y3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Homer1Q9Z2Y3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Homer1Q9Z2Y3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Homer1Q9Z2Y3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Homer1Q9Z2Y3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Homer1Q9Z2Y3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Homer1Q9Z2Y3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Homer1Q9Z2Y3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Homer1Q9Z2Y3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Homer1Q9Z2Y3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Homer1Q9Z2Y3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Homer1Q9Z2Y3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Homer1Q9Z2Y3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Homer1Q9Z2Y3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Homer1Q9Z2Y3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Homer1Q9Z2Y3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Homer1Q9Z2Y3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Homer1Q9Z2Y3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Homer1Q9Z2Y3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Homer1Q9Z2Y3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Homer1Q9Z2Y3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Homer1Q9Z2Y3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Homer1Q9Z2Y3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Homer1Q9Z2Y3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Homer1Q9Z2Y3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Homer1Q9Z2Y3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Homer1Q9Z2Y3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Homer1Q9Z2Y3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Homer1Q9Z2Y3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Homer1Q9Z2Y3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Homer1Q9Z2Y3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Homer1Q9Z2Y3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Homer1Q9Z2Y3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Homer1Q9Z2Y3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Homer1Q9Z2Y3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Homer1Q9Z2Y3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Homer1Q9Z2Y3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Homer1Q9Z2Y3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Homer1Q9Z2Y3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Homer1Q9Z2Y3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Homer1Q9Z2Y3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Homer1Q9Z2Y3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Homer1Q9Z2Y3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Homer1Q9Z2Y3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Homer1Q9Z2Y3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Homer1Q9Z2Y3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Homer1Q9Z2Y3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Homer1Q9Z2Y3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Homer1Q9Z2Y3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Homer1Q9Z2Y3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Homer1Q9Z2Y3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Homer1Q9Z2Y3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Homer1Q9Z2Y3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Homer1Q9Z2Y3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Homer1Q9Z2Y3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Homer1Q9Z2Y3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Homer1Q9Z2Y3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Homer1Q9Z2Y3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Homer1Q9Z2Y3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Homer1Q9Z2Y3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Homer1Q9Z2Y3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Homer1Q9Z2Y3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Homer1Q9Z2Y3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Homer1Q9Z2Y3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Homer1Q9Z2Y3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Homer1Q9Z2Y3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Homer1Q9Z2Y3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Homer1Q9Z2Y3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Homer1Q9Z2Y3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Homer1Q9Z2Y3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Homer1Q9Z2Y3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Homer1Q9Z2Y3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Homer1Q9Z2Y3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Homer1Q9Z2Y3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Homer1Q9Z2Y3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Homer1Q9Z2Y3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Homer1Q9Z2Y3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Homer1Q9Z2Y3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Homer1Q9Z2Y3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Homer1Q9Z2Y3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Homer1Q9Z2Y3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Homer1Q9Z2Y3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Homer1Q9Z2Y3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Homer1Q9Z2Y3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Homer1Q9Z2Y3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Homer1Q9Z2Y3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms