Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2H7

Gipc2, PDZ domain-containing protein GIPC2, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gipc2Q9Z2H7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gipc2Q9Z2H7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gipc2Q9Z2H7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gipc2Q9Z2H7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gipc2Q9Z2H7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gipc2Q9Z2H7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gipc2Q9Z2H7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gipc2Q9Z2H7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gipc2Q9Z2H7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gipc2Q9Z2H7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gipc2Q9Z2H7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gipc2Q9Z2H7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gipc2Q9Z2H7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gipc2Q9Z2H7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gipc2Q9Z2H7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Gipc2Q9Z2H7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Gipc2Q9Z2H7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gipc2Q9Z2H7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gipc2Q9Z2H7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gipc2Q9Z2H7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gipc2Q9Z2H7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gipc2Q9Z2H7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gipc2Q9Z2H7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gipc2Q9Z2H7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gipc2Q9Z2H7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gipc2Q9Z2H7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gipc2Q9Z2H7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gipc2Q9Z2H7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gipc2Q9Z2H7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gipc2Q9Z2H7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gipc2Q9Z2H7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gipc2Q9Z2H7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gipc2Q9Z2H7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gipc2Q9Z2H7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gipc2Q9Z2H7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gipc2Q9Z2H7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gipc2Q9Z2H7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gipc2Q9Z2H7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gipc2Q9Z2H7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gipc2Q9Z2H7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gipc2Q9Z2H7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gipc2Q9Z2H7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gipc2Q9Z2H7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gipc2Q9Z2H7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gipc2Q9Z2H7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gipc2Q9Z2H7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gipc2Q9Z2H7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gipc2Q9Z2H7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gipc2Q9Z2H7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gipc2Q9Z2H7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gipc2Q9Z2H7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gipc2Q9Z2H7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gipc2Q9Z2H7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gipc2Q9Z2H7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gipc2Q9Z2H7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gipc2Q9Z2H7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gipc2Q9Z2H7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gipc2Q9Z2H7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gipc2Q9Z2H7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gipc2Q9Z2H7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gipc2Q9Z2H7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gipc2Q9Z2H7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Gipc2Q9Z2H7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gipc2Q9Z2H7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gipc2Q9Z2H7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gipc2Q9Z2H7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gipc2Q9Z2H7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gipc2Q9Z2H7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gipc2Q9Z2H7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gipc2Q9Z2H7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gipc2Q9Z2H7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gipc2Q9Z2H7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gipc2Q9Z2H7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gipc2Q9Z2H7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gipc2Q9Z2H7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gipc2Q9Z2H7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gipc2Q9Z2H7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gipc2Q9Z2H7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gipc2Q9Z2H7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gipc2Q9Z2H7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gipc2Q9Z2H7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gipc2Q9Z2H7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gipc2Q9Z2H7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gipc2Q9Z2H7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gipc2Q9Z2H7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gipc2Q9Z2H7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gipc2Q9Z2H7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gipc2Q9Z2H7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gipc2Q9Z2H7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gipc2Q9Z2H7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gipc2Q9Z2H7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gipc2Q9Z2H7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gipc2Q9Z2H7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gipc2Q9Z2H7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gipc2Q9Z2H7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gipc2Q9Z2H7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gipc2Q9Z2H7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gipc2Q9Z2H7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gipc2Q9Z2H7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gipc2Q9Z2H7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms