Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1W4

Gdf11, Growth/differentiation factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf11Q9Z1W4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gdf11Q9Z1W4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gdf11Q9Z1W4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gdf11Q9Z1W4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gdf11Q9Z1W4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gdf11Q9Z1W4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gdf11Q9Z1W4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gdf11Q9Z1W4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gdf11Q9Z1W4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gdf11Q9Z1W4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gdf11Q9Z1W4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gdf11Q9Z1W4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gdf11Q9Z1W4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gdf11Q9Z1W4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gdf11Q9Z1W4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gdf11Q9Z1W4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gdf11Q9Z1W4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Gdf11Q9Z1W4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gdf11Q9Z1W4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Gdf11Q9Z1W4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gdf11Q9Z1W4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gdf11Q9Z1W4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gdf11Q9Z1W4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gdf11Q9Z1W4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gdf11Q9Z1W4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gdf11Q9Z1W4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gdf11Q9Z1W4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gdf11Q9Z1W4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gdf11Q9Z1W4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gdf11Q9Z1W4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gdf11Q9Z1W4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gdf11Q9Z1W4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gdf11Q9Z1W4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gdf11Q9Z1W4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gdf11Q9Z1W4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gdf11Q9Z1W4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Gdf11Q9Z1W4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gdf11Q9Z1W4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gdf11Q9Z1W4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gdf11Q9Z1W4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gdf11Q9Z1W4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gdf11Q9Z1W4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gdf11Q9Z1W4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gdf11Q9Z1W4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gdf11Q9Z1W4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Gdf11Q9Z1W4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Gdf11Q9Z1W4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gdf11Q9Z1W4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gdf11Q9Z1W4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gdf11Q9Z1W4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gdf11Q9Z1W4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gdf11Q9Z1W4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gdf11Q9Z1W4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gdf11Q9Z1W4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Gdf11Q9Z1W4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gdf11Q9Z1W4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gdf11Q9Z1W4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gdf11Q9Z1W4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gdf11Q9Z1W4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gdf11Q9Z1W4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gdf11Q9Z1W4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gdf11Q9Z1W4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gdf11Q9Z1W4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gdf11Q9Z1W4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gdf11Q9Z1W4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gdf11Q9Z1W4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gdf11Q9Z1W4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Gdf11Q9Z1W4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gdf11Q9Z1W4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gdf11Q9Z1W4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gdf11Q9Z1W4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gdf11Q9Z1W4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gdf11Q9Z1W4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gdf11Q9Z1W4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gdf11Q9Z1W4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gdf11Q9Z1W4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gdf11Q9Z1W4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gdf11Q9Z1W4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gdf11Q9Z1W4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gdf11Q9Z1W4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gdf11Q9Z1W4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gdf11Q9Z1W4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gdf11Q9Z1W4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gdf11Q9Z1W4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gdf11Q9Z1W4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gdf11Q9Z1W4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Gdf11Q9Z1W4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gdf11Q9Z1W4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gdf11Q9Z1W4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Gdf11Q9Z1W4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gdf11Q9Z1W4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gdf11Q9Z1W4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gdf11Q9Z1W4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gdf11Q9Z1W4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gdf11Q9Z1W4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gdf11Q9Z1W4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gdf11Q9Z1W4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gdf11Q9Z1W4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gdf11Q9Z1W4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gdf11Q9Z1W4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms