Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VarsQ9Z1Q9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
VarsQ9Z1Q9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VarsQ9Z1Q9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VarsQ9Z1Q9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VarsQ9Z1Q9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VarsQ9Z1Q9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VarsQ9Z1Q9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VarsQ9Z1Q9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
VarsQ9Z1Q9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VarsQ9Z1Q9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VarsQ9Z1Q9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VarsQ9Z1Q9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VarsQ9Z1Q9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VarsQ9Z1Q9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VarsQ9Z1Q9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VarsQ9Z1Q9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VarsQ9Z1Q9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VarsQ9Z1Q9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VarsQ9Z1Q9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VarsQ9Z1Q9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VarsQ9Z1Q9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VarsQ9Z1Q9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VarsQ9Z1Q9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VarsQ9Z1Q9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VarsQ9Z1Q9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VarsQ9Z1Q9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VarsQ9Z1Q9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VarsQ9Z1Q9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VarsQ9Z1Q9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VarsQ9Z1Q9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VarsQ9Z1Q9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VarsQ9Z1Q9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VarsQ9Z1Q9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VarsQ9Z1Q9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VarsQ9Z1Q9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VarsQ9Z1Q9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VarsQ9Z1Q9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VarsQ9Z1Q9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VarsQ9Z1Q9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VarsQ9Z1Q9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VarsQ9Z1Q9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VarsQ9Z1Q9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VarsQ9Z1Q9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VarsQ9Z1Q9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VarsQ9Z1Q9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VarsQ9Z1Q9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VarsQ9Z1Q9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VarsQ9Z1Q9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VarsQ9Z1Q9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VarsQ9Z1Q9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VarsQ9Z1Q9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VarsQ9Z1Q9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VarsQ9Z1Q9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VarsQ9Z1Q9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VarsQ9Z1Q9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VarsQ9Z1Q9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VarsQ9Z1Q9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VarsQ9Z1Q9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VarsQ9Z1Q9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VarsQ9Z1Q9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VarsQ9Z1Q9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VarsQ9Z1Q9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VarsQ9Z1Q9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VarsQ9Z1Q9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
VarsQ9Z1Q9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
VarsQ9Z1Q9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VarsQ9Z1Q9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VarsQ9Z1Q9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VarsQ9Z1Q9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VarsQ9Z1Q9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VarsQ9Z1Q9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VarsQ9Z1Q9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VarsQ9Z1Q9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VarsQ9Z1Q9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VarsQ9Z1Q9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VarsQ9Z1Q9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VarsQ9Z1Q9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VarsQ9Z1Q9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VarsQ9Z1Q9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VarsQ9Z1Q9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VarsQ9Z1Q9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VarsQ9Z1Q9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VarsQ9Z1Q9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VarsQ9Z1Q9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VarsQ9Z1Q9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VarsQ9Z1Q9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
VarsQ9Z1Q9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VarsQ9Z1Q9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms