Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z123

Sema4f, Semaphorin-4F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4fQ9Z123 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema4fQ9Z123 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema4fQ9Z123 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema4fQ9Z123 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema4fQ9Z123 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema4fQ9Z123 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema4fQ9Z123 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema4fQ9Z123 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema4fQ9Z123 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema4fQ9Z123 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema4fQ9Z123 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema4fQ9Z123 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema4fQ9Z123 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema4fQ9Z123 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema4fQ9Z123 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema4fQ9Z123 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema4fQ9Z123 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema4fQ9Z123 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema4fQ9Z123 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema4fQ9Z123 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema4fQ9Z123 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema4fQ9Z123 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema4fQ9Z123 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema4fQ9Z123 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema4fQ9Z123 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema4fQ9Z123 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema4fQ9Z123 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema4fQ9Z123 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema4fQ9Z123 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema4fQ9Z123 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema4fQ9Z123 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema4fQ9Z123 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema4fQ9Z123 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema4fQ9Z123 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema4fQ9Z123 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema4fQ9Z123 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sema4fQ9Z123 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sema4fQ9Z123 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sema4fQ9Z123 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sema4fQ9Z123 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sema4fQ9Z123 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Sema4fQ9Z123 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Sema4fQ9Z123 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Sema4fQ9Z123 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sema4fQ9Z123 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sema4fQ9Z123 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sema4fQ9Z123 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sema4fQ9Z123 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sema4fQ9Z123 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sema4fQ9Z123 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sema4fQ9Z123 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sema4fQ9Z123 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sema4fQ9Z123 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Sema4fQ9Z123 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sema4fQ9Z123 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sema4fQ9Z123 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sema4fQ9Z123 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sema4fQ9Z123 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sema4fQ9Z123 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sema4fQ9Z123 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sema4fQ9Z123 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sema4fQ9Z123 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sema4fQ9Z123 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sema4fQ9Z123 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sema4fQ9Z123 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sema4fQ9Z123 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sema4fQ9Z123 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sema4fQ9Z123 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sema4fQ9Z123 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Sema4fQ9Z123 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sema4fQ9Z123 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sema4fQ9Z123 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sema4fQ9Z123 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sema4fQ9Z123 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sema4fQ9Z123 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sema4fQ9Z123 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sema4fQ9Z123 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sema4fQ9Z123 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sema4fQ9Z123 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sema4fQ9Z123 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sema4fQ9Z123 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sema4fQ9Z123 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sema4fQ9Z123 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sema4fQ9Z123 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sema4fQ9Z123 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sema4fQ9Z123 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sema4fQ9Z123 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sema4fQ9Z123 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sema4fQ9Z123 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sema4fQ9Z123 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sema4fQ9Z123 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sema4fQ9Z123 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sema4fQ9Z123 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sema4fQ9Z123 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sema4fQ9Z123 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sema4fQ9Z123 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sema4fQ9Z123 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sema4fQ9Z123 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sema4fQ9Z123 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sema4fQ9Z123 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms