Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NgfrQ9Z0W1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NgfrQ9Z0W1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NgfrQ9Z0W1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NgfrQ9Z0W1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NgfrQ9Z0W1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NgfrQ9Z0W1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NgfrQ9Z0W1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NgfrQ9Z0W1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NgfrQ9Z0W1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NgfrQ9Z0W1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NgfrQ9Z0W1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NgfrQ9Z0W1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NgfrQ9Z0W1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NgfrQ9Z0W1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NgfrQ9Z0W1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NgfrQ9Z0W1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NgfrQ9Z0W1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NgfrQ9Z0W1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NgfrQ9Z0W1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NgfrQ9Z0W1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NgfrQ9Z0W1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NgfrQ9Z0W1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NgfrQ9Z0W1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NgfrQ9Z0W1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NgfrQ9Z0W1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NgfrQ9Z0W1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NgfrQ9Z0W1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NgfrQ9Z0W1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NgfrQ9Z0W1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NgfrQ9Z0W1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NgfrQ9Z0W1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NgfrQ9Z0W1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NgfrQ9Z0W1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NgfrQ9Z0W1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NgfrQ9Z0W1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NgfrQ9Z0W1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NgfrQ9Z0W1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NgfrQ9Z0W1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NgfrQ9Z0W1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NgfrQ9Z0W1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NgfrQ9Z0W1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NgfrQ9Z0W1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NgfrQ9Z0W1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NgfrQ9Z0W1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NgfrQ9Z0W1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NgfrQ9Z0W1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NgfrQ9Z0W1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NgfrQ9Z0W1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NgfrQ9Z0W1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NgfrQ9Z0W1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NgfrQ9Z0W1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NgfrQ9Z0W1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NgfrQ9Z0W1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NgfrQ9Z0W1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NgfrQ9Z0W1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NgfrQ9Z0W1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NgfrQ9Z0W1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NgfrQ9Z0W1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NgfrQ9Z0W1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NgfrQ9Z0W1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NgfrQ9Z0W1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NgfrQ9Z0W1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NgfrQ9Z0W1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NgfrQ9Z0W1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NgfrQ9Z0W1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NgfrQ9Z0W1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NgfrQ9Z0W1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NgfrQ9Z0W1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NgfrQ9Z0W1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NgfrQ9Z0W1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NgfrQ9Z0W1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NgfrQ9Z0W1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NgfrQ9Z0W1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NgfrQ9Z0W1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NgfrQ9Z0W1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NgfrQ9Z0W1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NgfrQ9Z0W1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NgfrQ9Z0W1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NgfrQ9Z0W1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NgfrQ9Z0W1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NgfrQ9Z0W1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NgfrQ9Z0W1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NgfrQ9Z0W1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NgfrQ9Z0W1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NgfrQ9Z0W1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NgfrQ9Z0W1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NgfrQ9Z0W1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NgfrQ9Z0W1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NgfrQ9Z0W1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NgfrQ9Z0W1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NgfrQ9Z0W1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NgfrQ9Z0W1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NgfrQ9Z0W1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NgfrQ9Z0W1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NgfrQ9Z0W1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NgfrQ9Z0W1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NgfrQ9Z0W1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NgfrQ9Z0W1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NgfrQ9Z0W1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms