Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0M6

Cd97, CD97 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd97Q9Z0M6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd97Q9Z0M6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd97Q9Z0M6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd97Q9Z0M6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd97Q9Z0M6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd97Q9Z0M6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd97Q9Z0M6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd97Q9Z0M6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd97Q9Z0M6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd97Q9Z0M6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cd97Q9Z0M6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Cd97Q9Z0M6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd97Q9Z0M6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd97Q9Z0M6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd97Q9Z0M6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd97Q9Z0M6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd97Q9Z0M6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd97Q9Z0M6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd97Q9Z0M6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd97Q9Z0M6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd97Q9Z0M6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd97Q9Z0M6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd97Q9Z0M6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd97Q9Z0M6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd97Q9Z0M6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd97Q9Z0M6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd97Q9Z0M6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd97Q9Z0M6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd97Q9Z0M6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd97Q9Z0M6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd97Q9Z0M6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd97Q9Z0M6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd97Q9Z0M6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd97Q9Z0M6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd97Q9Z0M6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd97Q9Z0M6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd97Q9Z0M6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd97Q9Z0M6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd97Q9Z0M6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd97Q9Z0M6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd97Q9Z0M6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd97Q9Z0M6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd97Q9Z0M6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd97Q9Z0M6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd97Q9Z0M6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd97Q9Z0M6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd97Q9Z0M6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd97Q9Z0M6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd97Q9Z0M6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd97Q9Z0M6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd97Q9Z0M6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd97Q9Z0M6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd97Q9Z0M6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd97Q9Z0M6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd97Q9Z0M6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd97Q9Z0M6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd97Q9Z0M6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd97Q9Z0M6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd97Q9Z0M6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd97Q9Z0M6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd97Q9Z0M6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd97Q9Z0M6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd97Q9Z0M6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd97Q9Z0M6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd97Q9Z0M6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd97Q9Z0M6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd97Q9Z0M6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd97Q9Z0M6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd97Q9Z0M6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd97Q9Z0M6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd97Q9Z0M6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd97Q9Z0M6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd97Q9Z0M6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd97Q9Z0M6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd97Q9Z0M6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd97Q9Z0M6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd97Q9Z0M6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd97Q9Z0M6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd97Q9Z0M6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd97Q9Z0M6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd97Q9Z0M6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd97Q9Z0M6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd97Q9Z0M6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd97Q9Z0M6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd97Q9Z0M6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd97Q9Z0M6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd97Q9Z0M6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd97Q9Z0M6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd97Q9Z0M6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd97Q9Z0M6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd97Q9Z0M6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd97Q9Z0M6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd97Q9Z0M6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd97Q9Z0M6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd97Q9Z0M6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd97Q9Z0M6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd97Q9Z0M6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd97Q9Z0M6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd97Q9Z0M6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd97Q9Z0M6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.6 ms