Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0I7

Slfn1, Schlafen 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn1Q9Z0I7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slfn1Q9Z0I7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slfn1Q9Z0I7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slfn1Q9Z0I7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Slfn1Q9Z0I7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slfn1Q9Z0I7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slfn1Q9Z0I7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slfn1Q9Z0I7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slfn1Q9Z0I7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slfn1Q9Z0I7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slfn1Q9Z0I7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slfn1Q9Z0I7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slfn1Q9Z0I7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slfn1Q9Z0I7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slfn1Q9Z0I7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slfn1Q9Z0I7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Slfn1Q9Z0I7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slfn1Q9Z0I7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slfn1Q9Z0I7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Slfn1Q9Z0I7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Slfn1Q9Z0I7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slfn1Q9Z0I7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slfn1Q9Z0I7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slfn1Q9Z0I7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slfn1Q9Z0I7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slfn1Q9Z0I7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slfn1Q9Z0I7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slfn1Q9Z0I7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slfn1Q9Z0I7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slfn1Q9Z0I7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slfn1Q9Z0I7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slfn1Q9Z0I7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slfn1Q9Z0I7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slfn1Q9Z0I7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slfn1Q9Z0I7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slfn1Q9Z0I7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slfn1Q9Z0I7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slfn1Q9Z0I7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slfn1Q9Z0I7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slfn1Q9Z0I7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slfn1Q9Z0I7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slfn1Q9Z0I7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slfn1Q9Z0I7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slfn1Q9Z0I7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slfn1Q9Z0I7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slfn1Q9Z0I7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slfn1Q9Z0I7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slfn1Q9Z0I7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slfn1Q9Z0I7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slfn1Q9Z0I7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Slfn1Q9Z0I7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slfn1Q9Z0I7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slfn1Q9Z0I7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slfn1Q9Z0I7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slfn1Q9Z0I7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slfn1Q9Z0I7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Slfn1Q9Z0I7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slfn1Q9Z0I7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Slfn1Q9Z0I7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slfn1Q9Z0I7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slfn1Q9Z0I7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slfn1Q9Z0I7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slfn1Q9Z0I7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slfn1Q9Z0I7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slfn1Q9Z0I7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Slfn1Q9Z0I7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Slfn1Q9Z0I7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Slfn1Q9Z0I7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Slfn1Q9Z0I7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slfn1Q9Z0I7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slfn1Q9Z0I7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slfn1Q9Z0I7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slfn1Q9Z0I7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slfn1Q9Z0I7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slfn1Q9Z0I7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slfn1Q9Z0I7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slfn1Q9Z0I7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slfn1Q9Z0I7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slfn1Q9Z0I7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slfn1Q9Z0I7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slfn1Q9Z0I7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slfn1Q9Z0I7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slfn1Q9Z0I7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slfn1Q9Z0I7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slfn1Q9Z0I7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slfn1Q9Z0I7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slfn1Q9Z0I7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slfn1Q9Z0I7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slfn1Q9Z0I7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slfn1Q9Z0I7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slfn1Q9Z0I7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slfn1Q9Z0I7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slfn1Q9Z0I7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slfn1Q9Z0I7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slfn1Q9Z0I7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slfn1Q9Z0I7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slfn1Q9Z0I7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slfn1Q9Z0I7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slfn1Q9Z0I7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slfn1Q9Z0I7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms