Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clip2Q9Z0H8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clip2Q9Z0H8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clip2Q9Z0H8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clip2Q9Z0H8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Clip2Q9Z0H8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clip2Q9Z0H8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clip2Q9Z0H8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clip2Q9Z0H8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clip2Q9Z0H8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clip2Q9Z0H8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clip2Q9Z0H8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Clip2Q9Z0H8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clip2Q9Z0H8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Clip2Q9Z0H8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clip2Q9Z0H8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clip2Q9Z0H8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clip2Q9Z0H8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clip2Q9Z0H8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Clip2Q9Z0H8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Clip2Q9Z0H8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clip2Q9Z0H8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clip2Q9Z0H8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clip2Q9Z0H8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clip2Q9Z0H8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clip2Q9Z0H8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clip2Q9Z0H8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clip2Q9Z0H8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clip2Q9Z0H8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clip2Q9Z0H8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clip2Q9Z0H8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clip2Q9Z0H8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clip2Q9Z0H8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clip2Q9Z0H8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clip2Q9Z0H8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clip2Q9Z0H8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clip2Q9Z0H8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Clip2Q9Z0H8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clip2Q9Z0H8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clip2Q9Z0H8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clip2Q9Z0H8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clip2Q9Z0H8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clip2Q9Z0H8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clip2Q9Z0H8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Clip2Q9Z0H8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clip2Q9Z0H8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clip2Q9Z0H8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clip2Q9Z0H8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clip2Q9Z0H8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clip2Q9Z0H8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clip2Q9Z0H8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clip2Q9Z0H8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clip2Q9Z0H8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Clip2Q9Z0H8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Clip2Q9Z0H8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Clip2Q9Z0H8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Clip2Q9Z0H8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Clip2Q9Z0H8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Clip2Q9Z0H8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clip2Q9Z0H8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Clip2Q9Z0H8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Clip2Q9Z0H8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Clip2Q9Z0H8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clip2Q9Z0H8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clip2Q9Z0H8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clip2Q9Z0H8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clip2Q9Z0H8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clip2Q9Z0H8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clip2Q9Z0H8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clip2Q9Z0H8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clip2Q9Z0H8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clip2Q9Z0H8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clip2Q9Z0H8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clip2Q9Z0H8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clip2Q9Z0H8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clip2Q9Z0H8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clip2Q9Z0H8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clip2Q9Z0H8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clip2Q9Z0H8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clip2Q9Z0H8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Clip2Q9Z0H8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clip2Q9Z0H8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clip2Q9Z0H8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clip2Q9Z0H8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clip2Q9Z0H8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clip2Q9Z0H8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clip2Q9Z0H8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clip2Q9Z0H8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clip2Q9Z0H8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clip2Q9Z0H8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clip2Q9Z0H8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clip2Q9Z0H8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clip2Q9Z0H8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clip2Q9Z0H8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Clip2Q9Z0H8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clip2Q9Z0H8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clip2Q9Z0H8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Clip2Q9Z0H8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clip2Q9Z0H8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clip2Q9Z0H8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.7 ms