Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVF8

Tusc2, Tumor suppressor candidate 2, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tusc2Q9WVF8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms