Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx1Q9WV80 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx1Q9WV80 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx1Q9WV80 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx1Q9WV80 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx1Q9WV80 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Snx1Q9WV80 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Snx1Q9WV80 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx1Q9WV80 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx1Q9WV80 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx1Q9WV80 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx1Q9WV80 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx1Q9WV80 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx1Q9WV80 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx1Q9WV80 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx1Q9WV80 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx1Q9WV80 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx1Q9WV80 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx1Q9WV80 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx1Q9WV80 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx1Q9WV80 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx1Q9WV80 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx1Q9WV80 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx1Q9WV80 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx1Q9WV80 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx1Q9WV80 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx1Q9WV80 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx1Q9WV80 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx1Q9WV80 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx1Q9WV80 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx1Q9WV80 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx1Q9WV80 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx1Q9WV80 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx1Q9WV80 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx1Q9WV80 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx1Q9WV80 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx1Q9WV80 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx1Q9WV80 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx1Q9WV80 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx1Q9WV80 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx1Q9WV80 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx1Q9WV80 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx1Q9WV80 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx1Q9WV80 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx1Q9WV80 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx1Q9WV80 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx1Q9WV80 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx1Q9WV80 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx1Q9WV80 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Snx1Q9WV80 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Snx1Q9WV80 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snx1Q9WV80 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Snx1Q9WV80 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snx1Q9WV80 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Snx1Q9WV80 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snx1Q9WV80 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Snx1Q9WV80 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snx1Q9WV80 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snx1Q9WV80 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Snx1Q9WV80 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snx1Q9WV80 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx1Q9WV80 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Snx1Q9WV80 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx1Q9WV80 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx1Q9WV80 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Snx1Q9WV80 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx1Q9WV80 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx1Q9WV80 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx1Q9WV80 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Snx1Q9WV80 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Snx1Q9WV80 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx1Q9WV80 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx1Q9WV80 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Snx1Q9WV80 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx1Q9WV80 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Snx1Q9WV80 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx1Q9WV80 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Snx1Q9WV80 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx1Q9WV80 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx1Q9WV80 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx1Q9WV80 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snx1Q9WV80 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snx1Q9WV80 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snx1Q9WV80 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snx1Q9WV80 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Snx1Q9WV80 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snx1Q9WV80 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snx1Q9WV80 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Snx1Q9WV80 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snx1Q9WV80 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snx1Q9WV80 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snx1Q9WV80 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Snx1Q9WV80 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Snx1Q9WV80 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Snx1Q9WV80 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx1Q9WV80 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx1Q9WV80 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx1Q9WV80 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx1Q9WV80 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx1Q9WV80 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms