Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV31

Arc, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArcQ9WV31 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ArcQ9WV31 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ArcQ9WV31 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ArcQ9WV31 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ArcQ9WV31 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ArcQ9WV31 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ArcQ9WV31 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ArcQ9WV31 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ArcQ9WV31 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ArcQ9WV31 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ArcQ9WV31 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ArcQ9WV31 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ArcQ9WV31 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ArcQ9WV31 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ArcQ9WV31 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ArcQ9WV31 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ArcQ9WV31 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ArcQ9WV31 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ArcQ9WV31 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ArcQ9WV31 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ArcQ9WV31 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ArcQ9WV31 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ArcQ9WV31 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ArcQ9WV31 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ArcQ9WV31 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ArcQ9WV31 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ArcQ9WV31 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ArcQ9WV31 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ArcQ9WV31 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ArcQ9WV31 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ArcQ9WV31 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ArcQ9WV31 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ArcQ9WV31 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ArcQ9WV31 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ArcQ9WV31 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ArcQ9WV31 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ArcQ9WV31 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ArcQ9WV31 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ArcQ9WV31 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ArcQ9WV31 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ArcQ9WV31 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ArcQ9WV31 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ArcQ9WV31 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ArcQ9WV31 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ArcQ9WV31 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ArcQ9WV31 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ArcQ9WV31 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ArcQ9WV31 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ArcQ9WV31 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ArcQ9WV31 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ArcQ9WV31 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ArcQ9WV31 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ArcQ9WV31 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ArcQ9WV31 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ArcQ9WV31 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ArcQ9WV31 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ArcQ9WV31 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ArcQ9WV31 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ArcQ9WV31 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ArcQ9WV31 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ArcQ9WV31 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ArcQ9WV31 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ArcQ9WV31 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ArcQ9WV31 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ArcQ9WV31 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ArcQ9WV31 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ArcQ9WV31 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ArcQ9WV31 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ArcQ9WV31 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ArcQ9WV31 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ArcQ9WV31 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ArcQ9WV31 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ArcQ9WV31 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ArcQ9WV31 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ArcQ9WV31 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ArcQ9WV31 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ArcQ9WV31 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ArcQ9WV31 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ArcQ9WV31 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ArcQ9WV31 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ArcQ9WV31 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ArcQ9WV31 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ArcQ9WV31 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ArcQ9WV31 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ArcQ9WV31 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ArcQ9WV31 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ArcQ9WV31 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ArcQ9WV31 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ArcQ9WV31 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ArcQ9WV31 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ArcQ9WV31 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ArcQ9WV31 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ArcQ9WV31 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ArcQ9WV31 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ArcQ9WV31 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ArcQ9WV31 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ArcQ9WV31 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ArcQ9WV31 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ArcQ9WV31 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ArcQ9WV31 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms