Protein–RNA interactions for Protein: Q9R2B6

St6galnac4, Alpha-N-acetyl-neuraminyl-2,3-beta-galactosyl-1,3-N-acetyl-galactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
St6galnac4Q9R2B6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
St6galnac4Q9R2B6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
St6galnac4Q9R2B6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
St6galnac4Q9R2B6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
St6galnac4Q9R2B6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
St6galnac4Q9R2B6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
St6galnac4Q9R2B6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
St6galnac4Q9R2B6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
St6galnac4Q9R2B6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
St6galnac4Q9R2B6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
St6galnac4Q9R2B6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
St6galnac4Q9R2B6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
St6galnac4Q9R2B6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
St6galnac4Q9R2B6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
St6galnac4Q9R2B6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
St6galnac4Q9R2B6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
St6galnac4Q9R2B6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
St6galnac4Q9R2B6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
St6galnac4Q9R2B6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
St6galnac4Q9R2B6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
St6galnac4Q9R2B6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
St6galnac4Q9R2B6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
St6galnac4Q9R2B6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
St6galnac4Q9R2B6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
St6galnac4Q9R2B6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
St6galnac4Q9R2B6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
St6galnac4Q9R2B6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
St6galnac4Q9R2B6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
St6galnac4Q9R2B6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
St6galnac4Q9R2B6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
St6galnac4Q9R2B6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
St6galnac4Q9R2B6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
St6galnac4Q9R2B6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
St6galnac4Q9R2B6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
St6galnac4Q9R2B6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
St6galnac4Q9R2B6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
St6galnac4Q9R2B6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
St6galnac4Q9R2B6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
St6galnac4Q9R2B6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
St6galnac4Q9R2B6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
St6galnac4Q9R2B6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
St6galnac4Q9R2B6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
St6galnac4Q9R2B6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
St6galnac4Q9R2B6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
St6galnac4Q9R2B6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
St6galnac4Q9R2B6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
St6galnac4Q9R2B6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
St6galnac4Q9R2B6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
St6galnac4Q9R2B6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
St6galnac4Q9R2B6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
St6galnac4Q9R2B6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
St6galnac4Q9R2B6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
St6galnac4Q9R2B6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
St6galnac4Q9R2B6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
St6galnac4Q9R2B6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
St6galnac4Q9R2B6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
St6galnac4Q9R2B6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
St6galnac4Q9R2B6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
St6galnac4Q9R2B6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
St6galnac4Q9R2B6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
St6galnac4Q9R2B6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
St6galnac4Q9R2B6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
St6galnac4Q9R2B6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
St6galnac4Q9R2B6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
St6galnac4Q9R2B6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
St6galnac4Q9R2B6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
St6galnac4Q9R2B6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
St6galnac4Q9R2B6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
St6galnac4Q9R2B6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
St6galnac4Q9R2B6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
St6galnac4Q9R2B6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
St6galnac4Q9R2B6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
St6galnac4Q9R2B6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
St6galnac4Q9R2B6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
St6galnac4Q9R2B6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
St6galnac4Q9R2B6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
St6galnac4Q9R2B6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
St6galnac4Q9R2B6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
St6galnac4Q9R2B6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
St6galnac4Q9R2B6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
St6galnac4Q9R2B6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
St6galnac4Q9R2B6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
St6galnac4Q9R2B6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
St6galnac4Q9R2B6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
St6galnac4Q9R2B6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
St6galnac4Q9R2B6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
St6galnac4Q9R2B6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
St6galnac4Q9R2B6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
St6galnac4Q9R2B6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
St6galnac4Q9R2B6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
St6galnac4Q9R2B6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
St6galnac4Q9R2B6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
St6galnac4Q9R2B6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
St6galnac4Q9R2B6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
St6galnac4Q9R2B6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
St6galnac4Q9R2B6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
St6galnac4Q9R2B6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
St6galnac4Q9R2B6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
St6galnac4Q9R2B6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
St6galnac4Q9R2B6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms