Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Trpc2Q9R244 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpc2Q9R244 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpc2Q9R244 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpc2Q9R244 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpc2Q9R244 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpc2Q9R244 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpc2Q9R244 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpc2Q9R244 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpc2Q9R244 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpc2Q9R244 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpc2Q9R244 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpc2Q9R244 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpc2Q9R244 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpc2Q9R244 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpc2Q9R244 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpc2Q9R244 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpc2Q9R244 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpc2Q9R244 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpc2Q9R244 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpc2Q9R244 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpc2Q9R244 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpc2Q9R244 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpc2Q9R244 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpc2Q9R244 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpc2Q9R244 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpc2Q9R244 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpc2Q9R244 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpc2Q9R244 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpc2Q9R244 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpc2Q9R244 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpc2Q9R244 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpc2Q9R244 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpc2Q9R244 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpc2Q9R244 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpc2Q9R244 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpc2Q9R244 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpc2Q9R244 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpc2Q9R244 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpc2Q9R244 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpc2Q9R244 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpc2Q9R244 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpc2Q9R244 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpc2Q9R244 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpc2Q9R244 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpc2Q9R244 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpc2Q9R244 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpc2Q9R244 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpc2Q9R244 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpc2Q9R244 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpc2Q9R244 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpc2Q9R244 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpc2Q9R244 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpc2Q9R244 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpc2Q9R244 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpc2Q9R244 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpc2Q9R244 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpc2Q9R244 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpc2Q9R244 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpc2Q9R244 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpc2Q9R244 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpc2Q9R244 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpc2Q9R244 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpc2Q9R244 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpc2Q9R244 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpc2Q9R244 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpc2Q9R244 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpc2Q9R244 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpc2Q9R244 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpc2Q9R244 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpc2Q9R244 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpc2Q9R244 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpc2Q9R244 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpc2Q9R244 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpc2Q9R244 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpc2Q9R244 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpc2Q9R244 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpc2Q9R244 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trpc2Q9R244 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trpc2Q9R244 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trpc2Q9R244 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trpc2Q9R244 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trpc2Q9R244 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trpc2Q9R244 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Trpc2Q9R244 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trpc2Q9R244 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trpc2Q9R244 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Trpc2Q9R244 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trpc2Q9R244 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trpc2Q9R244 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Trpc2Q9R244 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trpc2Q9R244 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trpc2Q9R244 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trpc2Q9R244 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trpc2Q9R244 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trpc2Q9R244 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trpc2Q9R244 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trpc2Q9R244 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trpc2Q9R244 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trpc2Q9R244 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms