Protein–RNA interactions for Protein: Q9R207

Nbn, Nibrin, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NbnQ9R207 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NbnQ9R207 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NbnQ9R207 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NbnQ9R207 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NbnQ9R207 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NbnQ9R207 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NbnQ9R207 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NbnQ9R207 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NbnQ9R207 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NbnQ9R207 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NbnQ9R207 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NbnQ9R207 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NbnQ9R207 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NbnQ9R207 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NbnQ9R207 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NbnQ9R207 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NbnQ9R207 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NbnQ9R207 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NbnQ9R207 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NbnQ9R207 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NbnQ9R207 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NbnQ9R207 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NbnQ9R207 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NbnQ9R207 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NbnQ9R207 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NbnQ9R207 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NbnQ9R207 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NbnQ9R207 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NbnQ9R207 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NbnQ9R207 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NbnQ9R207 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NbnQ9R207 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NbnQ9R207 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NbnQ9R207 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NbnQ9R207 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NbnQ9R207 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NbnQ9R207 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NbnQ9R207 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NbnQ9R207 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NbnQ9R207 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NbnQ9R207 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NbnQ9R207 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NbnQ9R207 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NbnQ9R207 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NbnQ9R207 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NbnQ9R207 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NbnQ9R207 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NbnQ9R207 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NbnQ9R207 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NbnQ9R207 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NbnQ9R207 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NbnQ9R207 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NbnQ9R207 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NbnQ9R207 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NbnQ9R207 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NbnQ9R207 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NbnQ9R207 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NbnQ9R207 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NbnQ9R207 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NbnQ9R207 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NbnQ9R207 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NbnQ9R207 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NbnQ9R207 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NbnQ9R207 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NbnQ9R207 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NbnQ9R207 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NbnQ9R207 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NbnQ9R207 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
NbnQ9R207 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NbnQ9R207 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NbnQ9R207 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NbnQ9R207 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NbnQ9R207 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NbnQ9R207 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NbnQ9R207 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NbnQ9R207 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NbnQ9R207 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NbnQ9R207 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NbnQ9R207 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NbnQ9R207 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NbnQ9R207 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NbnQ9R207 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NbnQ9R207 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NbnQ9R207 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NbnQ9R207 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NbnQ9R207 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NbnQ9R207 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NbnQ9R207 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NbnQ9R207 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NbnQ9R207 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NbnQ9R207 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NbnQ9R207 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NbnQ9R207 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NbnQ9R207 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NbnQ9R207 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NbnQ9R207 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NbnQ9R207 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NbnQ9R207 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NbnQ9R207 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NbnQ9R207 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms