Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P3

Psmb2, Proteasome subunit beta type-2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb2Q9R1P3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb2Q9R1P3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb2Q9R1P3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb2Q9R1P3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb2Q9R1P3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb2Q9R1P3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmb2Q9R1P3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmb2Q9R1P3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmb2Q9R1P3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmb2Q9R1P3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb2Q9R1P3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb2Q9R1P3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb2Q9R1P3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb2Q9R1P3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb2Q9R1P3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb2Q9R1P3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb2Q9R1P3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb2Q9R1P3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb2Q9R1P3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb2Q9R1P3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb2Q9R1P3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb2Q9R1P3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb2Q9R1P3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb2Q9R1P3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb2Q9R1P3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb2Q9R1P3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb2Q9R1P3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb2Q9R1P3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb2Q9R1P3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb2Q9R1P3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb2Q9R1P3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb2Q9R1P3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb2Q9R1P3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb2Q9R1P3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb2Q9R1P3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb2Q9R1P3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb2Q9R1P3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb2Q9R1P3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb2Q9R1P3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb2Q9R1P3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb2Q9R1P3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb2Q9R1P3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb2Q9R1P3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb2Q9R1P3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb2Q9R1P3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb2Q9R1P3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb2Q9R1P3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb2Q9R1P3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb2Q9R1P3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb2Q9R1P3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb2Q9R1P3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb2Q9R1P3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb2Q9R1P3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb2Q9R1P3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb2Q9R1P3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb2Q9R1P3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb2Q9R1P3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb2Q9R1P3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb2Q9R1P3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb2Q9R1P3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb2Q9R1P3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb2Q9R1P3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb2Q9R1P3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb2Q9R1P3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb2Q9R1P3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb2Q9R1P3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb2Q9R1P3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb2Q9R1P3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms