Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q8

Clec4e, C-type lectin domain family 4 member E, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4eQ9R0Q8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clec4eQ9R0Q8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clec4eQ9R0Q8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clec4eQ9R0Q8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clec4eQ9R0Q8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clec4eQ9R0Q8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clec4eQ9R0Q8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clec4eQ9R0Q8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clec4eQ9R0Q8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clec4eQ9R0Q8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clec4eQ9R0Q8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clec4eQ9R0Q8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clec4eQ9R0Q8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clec4eQ9R0Q8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clec4eQ9R0Q8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clec4eQ9R0Q8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clec4eQ9R0Q8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Clec4eQ9R0Q8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clec4eQ9R0Q8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clec4eQ9R0Q8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clec4eQ9R0Q8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clec4eQ9R0Q8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clec4eQ9R0Q8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clec4eQ9R0Q8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clec4eQ9R0Q8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clec4eQ9R0Q8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clec4eQ9R0Q8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clec4eQ9R0Q8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clec4eQ9R0Q8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clec4eQ9R0Q8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clec4eQ9R0Q8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clec4eQ9R0Q8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clec4eQ9R0Q8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clec4eQ9R0Q8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Clec4eQ9R0Q8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clec4eQ9R0Q8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clec4eQ9R0Q8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clec4eQ9R0Q8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clec4eQ9R0Q8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clec4eQ9R0Q8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clec4eQ9R0Q8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clec4eQ9R0Q8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clec4eQ9R0Q8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clec4eQ9R0Q8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clec4eQ9R0Q8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Clec4eQ9R0Q8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clec4eQ9R0Q8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clec4eQ9R0Q8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clec4eQ9R0Q8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clec4eQ9R0Q8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clec4eQ9R0Q8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clec4eQ9R0Q8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clec4eQ9R0Q8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clec4eQ9R0Q8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clec4eQ9R0Q8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clec4eQ9R0Q8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clec4eQ9R0Q8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clec4eQ9R0Q8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clec4eQ9R0Q8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clec4eQ9R0Q8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clec4eQ9R0Q8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Clec4eQ9R0Q8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Clec4eQ9R0Q8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Clec4eQ9R0Q8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clec4eQ9R0Q8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clec4eQ9R0Q8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clec4eQ9R0Q8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clec4eQ9R0Q8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clec4eQ9R0Q8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clec4eQ9R0Q8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clec4eQ9R0Q8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clec4eQ9R0Q8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clec4eQ9R0Q8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Clec4eQ9R0Q8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clec4eQ9R0Q8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clec4eQ9R0Q8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clec4eQ9R0Q8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clec4eQ9R0Q8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clec4eQ9R0Q8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clec4eQ9R0Q8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clec4eQ9R0Q8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clec4eQ9R0Q8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clec4eQ9R0Q8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clec4eQ9R0Q8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clec4eQ9R0Q8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clec4eQ9R0Q8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clec4eQ9R0Q8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clec4eQ9R0Q8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clec4eQ9R0Q8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clec4eQ9R0Q8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clec4eQ9R0Q8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clec4eQ9R0Q8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clec4eQ9R0Q8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clec4eQ9R0Q8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clec4eQ9R0Q8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clec4eQ9R0Q8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clec4eQ9R0Q8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clec4eQ9R0Q8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clec4eQ9R0Q8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clec4eQ9R0Q8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms