Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0N9

Syt9, Synaptotagmin-9, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt9Q9R0N9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syt9Q9R0N9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Syt9Q9R0N9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Syt9Q9R0N9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syt9Q9R0N9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syt9Q9R0N9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syt9Q9R0N9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syt9Q9R0N9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syt9Q9R0N9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syt9Q9R0N9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syt9Q9R0N9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Syt9Q9R0N9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syt9Q9R0N9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syt9Q9R0N9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syt9Q9R0N9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syt9Q9R0N9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syt9Q9R0N9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syt9Q9R0N9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syt9Q9R0N9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syt9Q9R0N9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syt9Q9R0N9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syt9Q9R0N9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syt9Q9R0N9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syt9Q9R0N9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syt9Q9R0N9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syt9Q9R0N9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syt9Q9R0N9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syt9Q9R0N9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Syt9Q9R0N9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syt9Q9R0N9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syt9Q9R0N9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syt9Q9R0N9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Syt9Q9R0N9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syt9Q9R0N9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syt9Q9R0N9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syt9Q9R0N9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syt9Q9R0N9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syt9Q9R0N9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syt9Q9R0N9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syt9Q9R0N9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syt9Q9R0N9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syt9Q9R0N9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syt9Q9R0N9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syt9Q9R0N9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syt9Q9R0N9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syt9Q9R0N9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syt9Q9R0N9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syt9Q9R0N9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syt9Q9R0N9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syt9Q9R0N9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syt9Q9R0N9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syt9Q9R0N9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syt9Q9R0N9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syt9Q9R0N9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syt9Q9R0N9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syt9Q9R0N9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syt9Q9R0N9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syt9Q9R0N9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syt9Q9R0N9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syt9Q9R0N9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syt9Q9R0N9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syt9Q9R0N9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syt9Q9R0N9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syt9Q9R0N9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syt9Q9R0N9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syt9Q9R0N9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syt9Q9R0N9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syt9Q9R0N9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syt9Q9R0N9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syt9Q9R0N9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syt9Q9R0N9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syt9Q9R0N9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syt9Q9R0N9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syt9Q9R0N9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Syt9Q9R0N9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syt9Q9R0N9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syt9Q9R0N9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syt9Q9R0N9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syt9Q9R0N9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syt9Q9R0N9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syt9Q9R0N9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syt9Q9R0N9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syt9Q9R0N9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syt9Q9R0N9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syt9Q9R0N9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syt9Q9R0N9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syt9Q9R0N9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Syt9Q9R0N9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syt9Q9R0N9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syt9Q9R0N9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syt9Q9R0N9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syt9Q9R0N9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syt9Q9R0N9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syt9Q9R0N9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syt9Q9R0N9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syt9Q9R0N9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syt9Q9R0N9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syt9Q9R0N9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syt9Q9R0N9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syt9Q9R0N9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms