Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M3

Srpx, Sushi-repeat-containing protein SRPX, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpxQ9R0M3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrpxQ9R0M3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrpxQ9R0M3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrpxQ9R0M3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrpxQ9R0M3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrpxQ9R0M3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrpxQ9R0M3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrpxQ9R0M3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrpxQ9R0M3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrpxQ9R0M3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrpxQ9R0M3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrpxQ9R0M3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrpxQ9R0M3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrpxQ9R0M3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrpxQ9R0M3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrpxQ9R0M3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrpxQ9R0M3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrpxQ9R0M3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrpxQ9R0M3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrpxQ9R0M3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrpxQ9R0M3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrpxQ9R0M3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrpxQ9R0M3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrpxQ9R0M3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrpxQ9R0M3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrpxQ9R0M3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrpxQ9R0M3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrpxQ9R0M3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrpxQ9R0M3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrpxQ9R0M3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrpxQ9R0M3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrpxQ9R0M3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SrpxQ9R0M3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SrpxQ9R0M3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrpxQ9R0M3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrpxQ9R0M3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrpxQ9R0M3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrpxQ9R0M3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrpxQ9R0M3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrpxQ9R0M3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SrpxQ9R0M3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrpxQ9R0M3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrpxQ9R0M3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SrpxQ9R0M3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SrpxQ9R0M3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SrpxQ9R0M3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SrpxQ9R0M3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SrpxQ9R0M3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SrpxQ9R0M3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SrpxQ9R0M3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SrpxQ9R0M3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SrpxQ9R0M3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrpxQ9R0M3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrpxQ9R0M3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrpxQ9R0M3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrpxQ9R0M3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrpxQ9R0M3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrpxQ9R0M3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrpxQ9R0M3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrpxQ9R0M3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SrpxQ9R0M3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SrpxQ9R0M3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrpxQ9R0M3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrpxQ9R0M3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrpxQ9R0M3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrpxQ9R0M3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrpxQ9R0M3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrpxQ9R0M3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrpxQ9R0M3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrpxQ9R0M3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SrpxQ9R0M3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrpxQ9R0M3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrpxQ9R0M3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrpxQ9R0M3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrpxQ9R0M3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrpxQ9R0M3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrpxQ9R0M3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrpxQ9R0M3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrpxQ9R0M3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrpxQ9R0M3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrpxQ9R0M3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrpxQ9R0M3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrpxQ9R0M3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrpxQ9R0M3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrpxQ9R0M3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrpxQ9R0M3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrpxQ9R0M3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrpxQ9R0M3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrpxQ9R0M3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SrpxQ9R0M3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrpxQ9R0M3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrpxQ9R0M3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SrpxQ9R0M3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrpxQ9R0M3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrpxQ9R0M3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrpxQ9R0M3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrpxQ9R0M3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrpxQ9R0M3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrpxQ9R0M3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrpxQ9R0M3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.3 ms