Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Zeb2Q9R0G7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Zeb2Q9R0G7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Zeb2Q9R0G7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Zeb2Q9R0G7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Zeb2Q9R0G7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Zeb2Q9R0G7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Zeb2Q9R0G7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Zeb2Q9R0G7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Zeb2Q9R0G7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Zeb2Q9R0G7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Zeb2Q9R0G7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Zeb2Q9R0G7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Zeb2Q9R0G7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Zeb2Q9R0G7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Zeb2Q9R0G7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Zeb2Q9R0G7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Zeb2Q9R0G7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Zeb2Q9R0G7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Zeb2Q9R0G7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Zeb2Q9R0G7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Zeb2Q9R0G7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Zeb2Q9R0G7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Zeb2Q9R0G7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Zeb2Q9R0G7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Zeb2Q9R0G7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Zeb2Q9R0G7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Zeb2Q9R0G7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Zeb2Q9R0G7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Zeb2Q9R0G7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Zeb2Q9R0G7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Zeb2Q9R0G7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Zeb2Q9R0G7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Zeb2Q9R0G7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Zeb2Q9R0G7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Zeb2Q9R0G7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Zeb2Q9R0G7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Zeb2Q9R0G7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Zeb2Q9R0G7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Zeb2Q9R0G7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Zeb2Q9R0G7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Zeb2Q9R0G7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Zeb2Q9R0G7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Zeb2Q9R0G7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Zeb2Q9R0G7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Zeb2Q9R0G7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Zeb2Q9R0G7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Zeb2Q9R0G7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Zeb2Q9R0G7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Zeb2Q9R0G7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Zeb2Q9R0G7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Zeb2Q9R0G7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Zeb2Q9R0G7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Zeb2Q9R0G7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Zeb2Q9R0G7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Zeb2Q9R0G7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Zeb2Q9R0G7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Zeb2Q9R0G7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Zeb2Q9R0G7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Zeb2Q9R0G7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Zeb2Q9R0G7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Zeb2Q9R0G7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Zeb2Q9R0G7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Zeb2Q9R0G7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Zeb2Q9R0G7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Zeb2Q9R0G7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Zeb2Q9R0G7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Zeb2Q9R0G7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Zeb2Q9R0G7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Zeb2Q9R0G7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Zeb2Q9R0G7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Zeb2Q9R0G7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Zeb2Q9R0G7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Zeb2Q9R0G7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Zeb2Q9R0G7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Zeb2Q9R0G7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Zeb2Q9R0G7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Zeb2Q9R0G7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Zeb2Q9R0G7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Zeb2Q9R0G7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Zeb2Q9R0G7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Zeb2Q9R0G7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Zeb2Q9R0G7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Zeb2Q9R0G7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Zeb2Q9R0G7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Zeb2Q9R0G7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Zeb2Q9R0G7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Zeb2Q9R0G7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Zeb2Q9R0G7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Zeb2Q9R0G7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Zeb2Q9R0G7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Zeb2Q9R0G7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Zeb2Q9R0G7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Zeb2Q9R0G7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Zeb2Q9R0G7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Zeb2Q9R0G7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Zeb2Q9R0G7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Zeb2Q9R0G7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Zeb2Q9R0G7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Zeb2Q9R0G7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms