Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Plod1Q9R0E2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Plod1Q9R0E2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Plod1Q9R0E2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Plod1Q9R0E2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Plod1Q9R0E2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Plod1Q9R0E2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Plod1Q9R0E2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Plod1Q9R0E2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Plod1Q9R0E2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Plod1Q9R0E2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Plod1Q9R0E2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Plod1Q9R0E2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Plod1Q9R0E2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Plod1Q9R0E2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Plod1Q9R0E2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Plod1Q9R0E2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Plod1Q9R0E2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Plod1Q9R0E2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Plod1Q9R0E2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Plod1Q9R0E2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Plod1Q9R0E2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Plod1Q9R0E2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Plod1Q9R0E2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Plod1Q9R0E2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Plod1Q9R0E2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Plod1Q9R0E2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Plod1Q9R0E2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Plod1Q9R0E2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Plod1Q9R0E2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Plod1Q9R0E2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Plod1Q9R0E2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Plod1Q9R0E2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Plod1Q9R0E2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Plod1Q9R0E2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Plod1Q9R0E2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Plod1Q9R0E2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Plod1Q9R0E2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Plod1Q9R0E2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Plod1Q9R0E2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Plod1Q9R0E2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Plod1Q9R0E2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Plod1Q9R0E2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Plod1Q9R0E2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Plod1Q9R0E2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Plod1Q9R0E2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Plod1Q9R0E2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Plod1Q9R0E2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Plod1Q9R0E2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Plod1Q9R0E2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Plod1Q9R0E2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Plod1Q9R0E2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Plod1Q9R0E2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Plod1Q9R0E2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Plod1Q9R0E2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Plod1Q9R0E2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Plod1Q9R0E2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Plod1Q9R0E2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Plod1Q9R0E2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Plod1Q9R0E2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Plod1Q9R0E2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Plod1Q9R0E2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Plod1Q9R0E2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Plod1Q9R0E2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Plod1Q9R0E2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Plod1Q9R0E2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Plod1Q9R0E2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Plod1Q9R0E2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Plod1Q9R0E2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Plod1Q9R0E2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Plod1Q9R0E2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Plod1Q9R0E2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Plod1Q9R0E2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Plod1Q9R0E2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Plod1Q9R0E2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Plod1Q9R0E2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Plod1Q9R0E2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Plod1Q9R0E2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Plod1Q9R0E2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Plod1Q9R0E2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Plod1Q9R0E2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Plod1Q9R0E2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Plod1Q9R0E2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Plod1Q9R0E2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Plod1Q9R0E2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Plod1Q9R0E2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Plod1Q9R0E2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Plod1Q9R0E2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Plod1Q9R0E2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Plod1Q9R0E2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Plod1Q9R0E2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Plod1Q9R0E2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Plod1Q9R0E2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Plod1Q9R0E2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Plod1Q9R0E2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Plod1Q9R0E2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Plod1Q9R0E2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Plod1Q9R0E2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Plod1Q9R0E2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Plod1Q9R0E2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms