Protein–RNA interactions for Protein: Q9R060

Nubp1, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP1, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp1Q9R060 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nubp1Q9R060 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nubp1Q9R060 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nubp1Q9R060 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nubp1Q9R060 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nubp1Q9R060 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nubp1Q9R060 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nubp1Q9R060 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nubp1Q9R060 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nubp1Q9R060 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nubp1Q9R060 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nubp1Q9R060 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nubp1Q9R060 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nubp1Q9R060 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nubp1Q9R060 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nubp1Q9R060 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nubp1Q9R060 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nubp1Q9R060 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nubp1Q9R060 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nubp1Q9R060 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nubp1Q9R060 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nubp1Q9R060 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nubp1Q9R060 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nubp1Q9R060 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nubp1Q9R060 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nubp1Q9R060 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nubp1Q9R060 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nubp1Q9R060 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nubp1Q9R060 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nubp1Q9R060 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nubp1Q9R060 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nubp1Q9R060 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nubp1Q9R060 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nubp1Q9R060 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nubp1Q9R060 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nubp1Q9R060 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nubp1Q9R060 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nubp1Q9R060 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nubp1Q9R060 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nubp1Q9R060 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nubp1Q9R060 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nubp1Q9R060 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nubp1Q9R060 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nubp1Q9R060 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nubp1Q9R060 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nubp1Q9R060 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nubp1Q9R060 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nubp1Q9R060 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nubp1Q9R060 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nubp1Q9R060 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nubp1Q9R060 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nubp1Q9R060 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nubp1Q9R060 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nubp1Q9R060 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nubp1Q9R060 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nubp1Q9R060 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nubp1Q9R060 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nubp1Q9R060 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nubp1Q9R060 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nubp1Q9R060 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nubp1Q9R060 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nubp1Q9R060 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nubp1Q9R060 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nubp1Q9R060 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nubp1Q9R060 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nubp1Q9R060 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nubp1Q9R060 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nubp1Q9R060 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nubp1Q9R060 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nubp1Q9R060 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nubp1Q9R060 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nubp1Q9R060 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nubp1Q9R060 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nubp1Q9R060 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nubp1Q9R060 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nubp1Q9R060 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nubp1Q9R060 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nubp1Q9R060 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nubp1Q9R060 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nubp1Q9R060 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nubp1Q9R060 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nubp1Q9R060 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nubp1Q9R060 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nubp1Q9R060 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nubp1Q9R060 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nubp1Q9R060 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nubp1Q9R060 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nubp1Q9R060 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nubp1Q9R060 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nubp1Q9R060 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nubp1Q9R060 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nubp1Q9R060 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nubp1Q9R060 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nubp1Q9R060 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nubp1Q9R060 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nubp1Q9R060 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nubp1Q9R060 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nubp1Q9R060 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nubp1Q9R060 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nubp1Q9R060 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms