Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AmfrQ9R049 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AmfrQ9R049 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AmfrQ9R049 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AmfrQ9R049 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AmfrQ9R049 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AmfrQ9R049 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AmfrQ9R049 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AmfrQ9R049 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AmfrQ9R049 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AmfrQ9R049 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AmfrQ9R049 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AmfrQ9R049 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AmfrQ9R049 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AmfrQ9R049 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AmfrQ9R049 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AmfrQ9R049 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AmfrQ9R049 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
AmfrQ9R049 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AmfrQ9R049 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AmfrQ9R049 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AmfrQ9R049 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
AmfrQ9R049 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AmfrQ9R049 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AmfrQ9R049 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AmfrQ9R049 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AmfrQ9R049 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AmfrQ9R049 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AmfrQ9R049 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AmfrQ9R049 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AmfrQ9R049 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AmfrQ9R049 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AmfrQ9R049 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
AmfrQ9R049 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AmfrQ9R049 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AmfrQ9R049 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
AmfrQ9R049 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AmfrQ9R049 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AmfrQ9R049 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AmfrQ9R049 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AmfrQ9R049 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AmfrQ9R049 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AmfrQ9R049 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AmfrQ9R049 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AmfrQ9R049 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AmfrQ9R049 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AmfrQ9R049 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AmfrQ9R049 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AmfrQ9R049 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AmfrQ9R049 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AmfrQ9R049 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
AmfrQ9R049 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AmfrQ9R049 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AmfrQ9R049 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AmfrQ9R049 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AmfrQ9R049 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AmfrQ9R049 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AmfrQ9R049 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AmfrQ9R049 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
AmfrQ9R049 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AmfrQ9R049 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AmfrQ9R049 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AmfrQ9R049 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AmfrQ9R049 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AmfrQ9R049 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AmfrQ9R049 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AmfrQ9R049 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AmfrQ9R049 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AmfrQ9R049 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AmfrQ9R049 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AmfrQ9R049 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AmfrQ9R049 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AmfrQ9R049 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AmfrQ9R049 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AmfrQ9R049 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AmfrQ9R049 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AmfrQ9R049 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AmfrQ9R049 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AmfrQ9R049 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AmfrQ9R049 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AmfrQ9R049 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AmfrQ9R049 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AmfrQ9R049 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AmfrQ9R049 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AmfrQ9R049 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AmfrQ9R049 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AmfrQ9R049 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AmfrQ9R049 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AmfrQ9R049 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AmfrQ9R049 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AmfrQ9R049 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
AmfrQ9R049 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AmfrQ9R049 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AmfrQ9R049 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AmfrQ9R049 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AmfrQ9R049 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AmfrQ9R049 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AmfrQ9R049 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AmfrQ9R049 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AmfrQ9R049 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms