Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp11cQ9QZW0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp11cQ9QZW0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp11cQ9QZW0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp11cQ9QZW0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp11cQ9QZW0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp11cQ9QZW0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp11cQ9QZW0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp11cQ9QZW0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp11cQ9QZW0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp11cQ9QZW0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp11cQ9QZW0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp11cQ9QZW0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp11cQ9QZW0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp11cQ9QZW0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp11cQ9QZW0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp11cQ9QZW0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp11cQ9QZW0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp11cQ9QZW0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp11cQ9QZW0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp11cQ9QZW0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp11cQ9QZW0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp11cQ9QZW0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp11cQ9QZW0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp11cQ9QZW0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp11cQ9QZW0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp11cQ9QZW0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp11cQ9QZW0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp11cQ9QZW0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp11cQ9QZW0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp11cQ9QZW0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp11cQ9QZW0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp11cQ9QZW0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp11cQ9QZW0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp11cQ9QZW0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp11cQ9QZW0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp11cQ9QZW0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp11cQ9QZW0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp11cQ9QZW0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp11cQ9QZW0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp11cQ9QZW0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp11cQ9QZW0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp11cQ9QZW0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp11cQ9QZW0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp11cQ9QZW0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp11cQ9QZW0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp11cQ9QZW0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp11cQ9QZW0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp11cQ9QZW0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp11cQ9QZW0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp11cQ9QZW0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp11cQ9QZW0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp11cQ9QZW0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp11cQ9QZW0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp11cQ9QZW0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp11cQ9QZW0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp11cQ9QZW0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp11cQ9QZW0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp11cQ9QZW0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp11cQ9QZW0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp11cQ9QZW0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp11cQ9QZW0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp11cQ9QZW0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp11cQ9QZW0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atp11cQ9QZW0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atp11cQ9QZW0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Atp11cQ9QZW0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atp11cQ9QZW0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atp11cQ9QZW0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp11cQ9QZW0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp11cQ9QZW0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp11cQ9QZW0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp11cQ9QZW0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp11cQ9QZW0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp11cQ9QZW0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp11cQ9QZW0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp11cQ9QZW0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp11cQ9QZW0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp11cQ9QZW0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp11cQ9QZW0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp11cQ9QZW0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp11cQ9QZW0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp11cQ9QZW0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp11cQ9QZW0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp11cQ9QZW0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp11cQ9QZW0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp11cQ9QZW0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp11cQ9QZW0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp11cQ9QZW0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp11cQ9QZW0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp11cQ9QZW0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp11cQ9QZW0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp11cQ9QZW0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp11cQ9QZW0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp11cQ9QZW0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp11cQ9QZW0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp11cQ9QZW0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp11cQ9QZW0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp11cQ9QZW0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp11cQ9QZW0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms