Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ubxn8Q9QZ49 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ubxn8Q9QZ49 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ubxn8Q9QZ49 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ubxn8Q9QZ49 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ubxn8Q9QZ49 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ubxn8Q9QZ49 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ubxn8Q9QZ49 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ubxn8Q9QZ49 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ubxn8Q9QZ49 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ubxn8Q9QZ49 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ubxn8Q9QZ49 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ubxn8Q9QZ49 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ubxn8Q9QZ49 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ubxn8Q9QZ49 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ubxn8Q9QZ49 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ubxn8Q9QZ49 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ubxn8Q9QZ49 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ubxn8Q9QZ49 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ubxn8Q9QZ49 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ubxn8Q9QZ49 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ubxn8Q9QZ49 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ubxn8Q9QZ49 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ubxn8Q9QZ49 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ubxn8Q9QZ49 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ubxn8Q9QZ49 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ubxn8Q9QZ49 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ubxn8Q9QZ49 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ubxn8Q9QZ49 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ubxn8Q9QZ49 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ubxn8Q9QZ49 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ubxn8Q9QZ49 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ubxn8Q9QZ49 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ubxn8Q9QZ49 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ubxn8Q9QZ49 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ubxn8Q9QZ49 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ubxn8Q9QZ49 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ubxn8Q9QZ49 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ubxn8Q9QZ49 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ubxn8Q9QZ49 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ubxn8Q9QZ49 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ubxn8Q9QZ49 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ubxn8Q9QZ49 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ubxn8Q9QZ49 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ubxn8Q9QZ49 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ubxn8Q9QZ49 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ubxn8Q9QZ49 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ubxn8Q9QZ49 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ubxn8Q9QZ49 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ubxn8Q9QZ49 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ubxn8Q9QZ49 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ubxn8Q9QZ49 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ubxn8Q9QZ49 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ubxn8Q9QZ49 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ubxn8Q9QZ49 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ubxn8Q9QZ49 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ubxn8Q9QZ49 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ubxn8Q9QZ49 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ubxn8Q9QZ49 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ubxn8Q9QZ49 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ubxn8Q9QZ49 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ubxn8Q9QZ49 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ubxn8Q9QZ49 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ubxn8Q9QZ49 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ubxn8Q9QZ49 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ubxn8Q9QZ49 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ubxn8Q9QZ49 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ubxn8Q9QZ49 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ubxn8Q9QZ49 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ubxn8Q9QZ49 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ubxn8Q9QZ49 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ubxn8Q9QZ49 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ubxn8Q9QZ49 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ubxn8Q9QZ49 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ubxn8Q9QZ49 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ubxn8Q9QZ49 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ubxn8Q9QZ49 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ubxn8Q9QZ49 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ubxn8Q9QZ49 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ubxn8Q9QZ49 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ubxn8Q9QZ49 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubxn8Q9QZ49 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubxn8Q9QZ49 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubxn8Q9QZ49 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubxn8Q9QZ49 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubxn8Q9QZ49 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubxn8Q9QZ49 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubxn8Q9QZ49 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubxn8Q9QZ49 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubxn8Q9QZ49 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubxn8Q9QZ49 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ubxn8Q9QZ49 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ubxn8Q9QZ49 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ubxn8Q9QZ49 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ubxn8Q9QZ49 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ubxn8Q9QZ49 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ubxn8Q9QZ49 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ubxn8Q9QZ49 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ubxn8Q9QZ49 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 722.2 ms