Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Nphp1Q9QY53 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nphp1Q9QY53 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nphp1Q9QY53 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nphp1Q9QY53 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nphp1Q9QY53 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nphp1Q9QY53 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nphp1Q9QY53 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nphp1Q9QY53 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nphp1Q9QY53 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nphp1Q9QY53 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nphp1Q9QY53 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nphp1Q9QY53 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nphp1Q9QY53 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nphp1Q9QY53 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nphp1Q9QY53 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nphp1Q9QY53 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nphp1Q9QY53 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nphp1Q9QY53 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nphp1Q9QY53 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nphp1Q9QY53 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nphp1Q9QY53 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nphp1Q9QY53 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nphp1Q9QY53 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Nphp1Q9QY53 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nphp1Q9QY53 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nphp1Q9QY53 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nphp1Q9QY53 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nphp1Q9QY53 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nphp1Q9QY53 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nphp1Q9QY53 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nphp1Q9QY53 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Nphp1Q9QY53 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nphp1Q9QY53 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nphp1Q9QY53 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Nphp1Q9QY53 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nphp1Q9QY53 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nphp1Q9QY53 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nphp1Q9QY53 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nphp1Q9QY53 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nphp1Q9QY53 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Nphp1Q9QY53 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nphp1Q9QY53 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nphp1Q9QY53 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nphp1Q9QY53 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nphp1Q9QY53 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nphp1Q9QY53 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Nphp1Q9QY53 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nphp1Q9QY53 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nphp1Q9QY53 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nphp1Q9QY53 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nphp1Q9QY53 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nphp1Q9QY53 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nphp1Q9QY53 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nphp1Q9QY53 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nphp1Q9QY53 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Nphp1Q9QY53 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nphp1Q9QY53 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nphp1Q9QY53 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nphp1Q9QY53 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nphp1Q9QY53 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nphp1Q9QY53 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nphp1Q9QY53 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nphp1Q9QY53 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Nphp1Q9QY53 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nphp1Q9QY53 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nphp1Q9QY53 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Nphp1Q9QY53 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Nphp1Q9QY53 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nphp1Q9QY53 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nphp1Q9QY53 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Nphp1Q9QY53 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nphp1Q9QY53 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nphp1Q9QY53 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nphp1Q9QY53 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nphp1Q9QY53 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nphp1Q9QY53 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nphp1Q9QY53 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nphp1Q9QY53 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nphp1Q9QY53 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nphp1Q9QY53 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nphp1Q9QY53 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nphp1Q9QY53 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nphp1Q9QY53 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nphp1Q9QY53 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nphp1Q9QY53 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nphp1Q9QY53 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Nphp1Q9QY53 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nphp1Q9QY53 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nphp1Q9QY53 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nphp1Q9QY53 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nphp1Q9QY53 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Nphp1Q9QY53 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nphp1Q9QY53 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nphp1Q9QY53 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nphp1Q9QY53 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nphp1Q9QY53 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nphp1Q9QY53 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Nphp1Q9QY53 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Nphp1Q9QY53 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms