Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdzd4Q9QY39 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdzd4Q9QY39 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdzd4Q9QY39 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdzd4Q9QY39 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdzd4Q9QY39 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdzd4Q9QY39 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdzd4Q9QY39 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdzd4Q9QY39 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdzd4Q9QY39 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdzd4Q9QY39 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdzd4Q9QY39 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdzd4Q9QY39 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdzd4Q9QY39 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdzd4Q9QY39 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdzd4Q9QY39 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdzd4Q9QY39 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdzd4Q9QY39 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdzd4Q9QY39 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdzd4Q9QY39 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdzd4Q9QY39 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdzd4Q9QY39 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdzd4Q9QY39 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdzd4Q9QY39 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdzd4Q9QY39 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdzd4Q9QY39 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdzd4Q9QY39 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdzd4Q9QY39 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdzd4Q9QY39 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdzd4Q9QY39 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdzd4Q9QY39 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdzd4Q9QY39 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdzd4Q9QY39 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdzd4Q9QY39 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdzd4Q9QY39 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdzd4Q9QY39 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdzd4Q9QY39 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdzd4Q9QY39 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdzd4Q9QY39 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdzd4Q9QY39 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdzd4Q9QY39 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdzd4Q9QY39 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pdzd4Q9QY39 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pdzd4Q9QY39 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pdzd4Q9QY39 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdzd4Q9QY39 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdzd4Q9QY39 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdzd4Q9QY39 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdzd4Q9QY39 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdzd4Q9QY39 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdzd4Q9QY39 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdzd4Q9QY39 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdzd4Q9QY39 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdzd4Q9QY39 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdzd4Q9QY39 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdzd4Q9QY39 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdzd4Q9QY39 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdzd4Q9QY39 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdzd4Q9QY39 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdzd4Q9QY39 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdzd4Q9QY39 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdzd4Q9QY39 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdzd4Q9QY39 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdzd4Q9QY39 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdzd4Q9QY39 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdzd4Q9QY39 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdzd4Q9QY39 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdzd4Q9QY39 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdzd4Q9QY39 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdzd4Q9QY39 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdzd4Q9QY39 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdzd4Q9QY39 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdzd4Q9QY39 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdzd4Q9QY39 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdzd4Q9QY39 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdzd4Q9QY39 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdzd4Q9QY39 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdzd4Q9QY39 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdzd4Q9QY39 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdzd4Q9QY39 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdzd4Q9QY39 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdzd4Q9QY39 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdzd4Q9QY39 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdzd4Q9QY39 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdzd4Q9QY39 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdzd4Q9QY39 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdzd4Q9QY39 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdzd4Q9QY39 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdzd4Q9QY39 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdzd4Q9QY39 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdzd4Q9QY39 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdzd4Q9QY39 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdzd4Q9QY39 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdzd4Q9QY39 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdzd4Q9QY39 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdzd4Q9QY39 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdzd4Q9QY39 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdzd4Q9QY39 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdzd4Q9QY39 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdzd4Q9QY39 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms